1. Centrum rozlicza się z budżetem państwa w części 46 – Zdrowie, w dziale 851 – Ochrona zdrowia.
2. Źródłem przychodów Centrum są wpływy pochodzące z:
1) prowadzonej działalności szkoleniowej z zakresu ochrony radiologicznej;
2) dokonywanych opracowań, tłumaczeń oraz publikowanych materiałów szkoleniowych;
3) certyfikowania laboratoriów prowadzących dla celów ochrony radiologicznej pacjentów ocenę parametrów technicznych aparatury rentgeno-diagnostycznej;
4) skalowania aparatury kontrolno-pomiarowej do pomiaru promieniowania jonizującego dla celów ochrony radiologicznej.
3. Źródło przychodów Centrum mogą stanowić dotacje przedmiotowe otrzymywane na zasadach określonych w przepisach o finansach publicznych.