Nadpłata podatku wynikającego z rocznego rozliczenia PIT, którą urząd skarbowy zwróci podatnikowi, ma miejsce, kiedy suma zaliczek na PIT pobranych czy zapłaconych w ciągu zeszłego roku przewyższa podatek obliczony na zeznaniu rocznym. Zwrotu zaliczek spodziewać się mogą przede wszystkim ci, których łączne dochody w ubiegłym roku podatkowym nie przekroczyły kwoty wolnej od podatku, tj. 3091 zł.
Właściciel nieruchomości (domu, mieszkania lub działki) może zapłacić PIT, nawet gdy przekaże je za darmo jako zachowek, albo gdy zlicytuje je komornik. Trzeba być czujnym także przy dziale spadku oraz zamianie lokali, bo w takiej sytuacji łatwo przeoczyć, że nie doszło jeszcze do upływu pięciu lat od nabycia. Wskazują na to zarówno interpretacje izb skarbowych, jak i wyroki sądów.